2003年4月，在乡镇工作了14年的杨永聚被调任方城县人口计生委主任、党委书记。当时，方城县的人口计生工作在南阳市排名比较靠后。5年后的2008年6月，方城县被省委、省政府命名为“计划生育优质服务先进县”，摘取了全省人口计生工作的最高荣誉。县人口计生委先后被省委、省政府命名为“省级文明单位”、“全省人口计生工作先进单位”等。5年来，南阳市先后在方城召开了8次高规格的计生工作现场会。杨永聚也获得“全国婚育新风进万家活动先进个人”、“全国计划生育协会工作先进志愿者”称号，荣立个人三等功。这众多的荣誉记录了杨永聚带领全县广大计生工作者负重拼搏、无私奉献、一年一个台阶的奋斗历程。
上任伊始，杨永聚跑遍了全县16个乡镇和一部分行政村，听汇报、搞座谈，查找人口计生工作存在的问题，倾听机关干部和基层群众的意见和建议。针对全县计划生育工作存在的问题。他提出了“整顿队伍，转变作风；内强素质，外树形象；强化责任，严肃政策；依法治理，重点突破；整体推进，再上台阶”的工作方针和争创省级优质服务先进县的奋斗目标，建立健全了机关工作和队伍管理规章制度，并实施了“民主推荐、考试演讲、竞聘上岗、培训提高、党委把关、优胜劣汰”的干部使用和管理机制以及中层正职岗位轮换制，有效地调动了同志们干事创业的积极性。杨永聚上任半月后，便针对个别二级单位疏于管理、人心涣散、纪律松懈、违纪问题时有发，生的情况，进行统一整编，优化组合，实行全员培训、考试，择优录用，统一持证执法，使这支曾被视为“包袱”的松散队伍成为全县人口计生工作的中坚力量。
从事过计划生育工作的人都知道，干这一行没有一天能清静下来。5年多来，一杨永聚没有一天懈怠和松劲，他深知作为“一把手”，不仅要有驾驭全局的能力，还要以身作则。杨永聚经常工作废寝忘食，半夜还在思考问题，多少次深夜起床把想到的工作记在纸上，或用手机短信发给分管相关工作的班子成员。2003年半年考评期间，由于患上了呼吸道和肺部感染，他连续咳嗽了一个多月，仍带病坚持工作，在办公，室边输液边听取汇报。老母亲过生日，兄妹们都回家了，只有他因为工作忙而不能陪老人家。
每年“双节”期间，杨永聚都要到农村贫困计生家庭看望慰问，为他们送去慰问金、棉被、面粉等，对计划生育家庭开展帮扶活动。2007年5月，他带领班子成员深入村组，为27户计划生育家庭送去农资和现金6500元，帮助他们发展辣椒、花生、烟叶等经济作物；为12户独生子女家庭每户送去建设沼气资金300元，帮助独生子女家庭发展生产，改善生活条件。自2005年起，每年杨永聚都号召机关干部职工捐款资助被高校录取的贫困计划生育户女大学生。几年来，县计生委先后为91名贫困女大学生每人资助3000元学费，帮助这些贫困家庭的女孩圆了大学梦。这些爱心善举，使那些贫困女生和计生户切实感受到了计生优抚政策的实惠和计生干部的特别关爱，引起了社会的强烈反响。
坚持依法行政是计划生育工作的生命线。杨永聚解放思想，大胆创新，于2007年首创了社会抚养费征收续查机制，有效地遏制了违规征收社会抚养费、“放水养鱼”现象的发生，促进了全县人口计划的顺利完成和依法行政工作水平的提高。他们的做法得到了省、市人口计生委领导的充分肯定，并被推广。为了解决出生人口性别比偏高这一社会问题，他在借鉴外地经验的基础上，积极建议县委、县政府在全县深入扎实地开展性别比升高问题专项治理工作，县人口计生委联合卫生、公安、药监等单位成立“性别比治理协调联络办公室”，全县B超实行统一编号、统一监管，清理清查B超使用情况、药品管理销售市场，依法收缴非法鉴定胎儿性别的“黑B超”和非法终止妊娠的各种手术器械、药品，严肃查处违法行医和违法经销妊娠药品人员，确保了全县出生人口性别比逐步趋于正常。为了有效治理党员、干部超生问题，他主动协调县纪检监察部门，建立联合办案机制，依法查处违法生育(抱养)的党员、干部，进一步严肃了计划生育法律、法规和政策，在全县营造了违法生育必究的浓厚氛围。城区计生管理工作是一个全省乃至全国性的“老大难”问题，杨永聚经过缜密考虑，与班子成员反复磋商，按照“属地管理、单位负责、居民自治、综合治理”的原则，在城区扎实开展计划生育集中整治活动，有效地堵塞了因“人户分离”造成的管理漏洞。这一成功经验先后被省政府、省人口计生委推广。